La Comisión de la Distinción es la encargada de determinar los ganadores de los Premios Houssay, Premios Houssay Trayectoria y Premios Rebeca Gerschman, en las distintas áreas, entre aquellos candidatos propuestos por las Comisiones de Evaluación. Está conformada por:
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el señor ministro de Ciencia, Tecnología e Innovación Productiva, Dr. Lino Barañao
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el señor ministro de Educación, Prof. Alberto Sileoni.
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la señora secretaria de Planeamiento y Políticas del Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación Productiva, Dra. Ruth Ladenheim.
Esta comisión también tendrá como función elevar al Poder Ejecutivo la propuesta de nombramiento del Investigador/a de la Nación Argentina entre los ganadores de los Premios Houssay Trayectoria.